孢子植物与功能基因组学实验室是学校2005年立项建立的科技创新实验室，该实验室以植物学、生物化学与分子生物学、遗传学、水生生物学等学科为支撑，以孢子植物研究为特色、利用现代植物生物技术和经典手段以及先进的科学研究平台，在植物基因的分离和功能鉴定、重要孢子植物类群的系统分类等方面取得突破，为上海市社会和经济发展服务。

近年来，本实验室共主持科研项目50余项，科研经费1500余万元。国家973项目1项，国家自然科学基金重点项目1项，国家自然科学基金面上项目13项，国家科技基础研究项目1项，973预研1项，国家973、948、863自然基金重点等子课题6项；上海市基础研究重点项目3项，上海市基础研究重大项目1项，上海市曙光项目1项，浦江人才项目2项，上海市科技启明星项目2项，上海市自然科学基金2项，上海市西部开发专项项目2项；上海市教委项目20余项。2005年以来发表论文100余篇，其中SCI收录的40余篇；出版学术著作3部；申请发明专利6项。获省部级科研奖励3项。

本实验室由孢子植物生物学和植物功能基因组学两大部分组成。

孢子植物生物学方向：主要研究领域包括藻类系统与分类、藻类生态与环境、藻类分子生物学与微藻生物技术；苔藓植物的系统分类、苔藓生态及对环境的指示作用；蕨类植物配子体发育生物学以及孢粉学等。

植物功能基因组学方向：主要研究内容包括植物发育的机理及其调控功能基因组学；重要农作物农艺性状基因定位和分子育种学；药用植物次生代谢途径及其调控功能基因组学等。

实验室主任：王全喜  教授     实验室副主任：杨仲南  教授

实验室秘书：魏兰珍

学术委员会

主  任：陈家宽  教授    复旦大学生物多样性研究所

副主任：曹  同  教授    上海师范大学生环学院

成  员：胡征宇  研究员  中科院水生生物研究所

        林鸿宣  研究员  中科院上海植物生理生态研究所

傅承新  教授    浙江大学生命科学学院

        叶  德  教授    中国农业大学生命科学学院

        王幼芳  教授    华东师范大学生命科学学院