微生物学硕士点建立于1996年,
是生命与环境科学学院成立最早的硕士点之一，是我校每年报考人数最多的专业之一。
（一）培养目标
1．努力学习马列主义、毛泽东思想和邓小平理论，坚持党的基本路线，热爱祖国，遵纪守法，品德良好，学风严谨，具有较强的事业心和献身精神，积极为社会主义现代化建设以及人类的进步事业服务。
2．掌握坚实宽广的理论基础和系统深入的专门知识，具有独立从事科学研究工作的能力和社会管理方面的适应性，在科学和管理上能作出创造性的研究成果。
3．积极参加体育锻炼，身体健康。
4．硕士应达到的要求：
1）具有良好的政治素质和道德素养；
2）掌握本学科基本理论、专门知识和技能，
有独立从事科研的能力；
3）能熟练地利用外语阅读专业文献，具有较好的外语听说和科学论文写作能力；
4）具备健康的体魄和良好的心理素质。
（二）方向设置：
现在的微生物学硕士点有研究方向3个：微生物分子生物学，微生物药物学和食品微生物学及应用。
（三）师资队伍：
硕士生导师10人，包括学科带头人，微生物分子生物学方向负责人肖明教授,
微生物药物学方向负责人杨晓彤副教授,
食品微生物学及应用方向负责人周小理教授(兼职),
还有资深的陈代杰教授(兼职)、陶黎明教授(兼职)、袁萍教授、高菊芳副教授、陈军副教授、茅仁刚高级工程师(兼职)、龚钢明副教授(兼职)。该硕士点已经为国家培养硕士生60多人；
目前在校的硕士生35人。
（四）主要科研成果：
1.
承担国家和地方的科研项目30多项，包括国家自然科学基金项目，国家科技部十五攻关项目，国家教育部重点项目，中国博士后科学基金项目，上海科委重大项目，上海市教委发展基金项目等;
此外，
还承担企事业单位合作委托项目和国际组织资助项目多项。
2.
已获专利多项,
国家级二类新药云芝糖肽(PSP)及其胶囊先后获得过国家教委科学技术进步二等奖、上海市科学技术进步二等奖等国家及市级奖励9项，
直接经济效益达1.3亿。
3.
发表的科研论文百余篇，其中SCI文章30余篇。
（五）就业方向
研究生毕业后可以在工厂，企业，科研单位，教育单位，其它事业单位从事微生物分子生物学、微生物制药、食品微生物学等方面的工作。
微生物结构简单，生命周期短，是生命科学很好的研究材料,
是基因供体、受体、载体的主要来源，是生物制药、环境保护、能源开发、发酵工程、基因工程等相关企事业单位的利用的对象，而研究微生物的实验技术已经广泛地应用到其它领域。因此，从近年来的就业情况看，该专业的毕业生显示了明显的竞争优势，受到用人单位的欢迎。不少毕业生已成为用人单位的业务骨干，用人单位普遍反映，这些毕业生知识面广，专业性强，适应能力强，具有高度的事业心和责任感。