2007年发表论文：

1.Zhang ZB, Zhu J, Gao JF, Wang C, Li H, Zhang HQ, Zhang S, Wang DM, Wang QX, Huang H, Xia HJ, Yang ZN*. 2007. Transcription Factor AtMYB103 is Required for Anther Development by Regulating Microspore Release from Tetrads and Exine Formation in Arabidopsis.  Plant Journal   52(3): 528-538

2.Jia N, Lian Q, Shen HB, Wang C, Li XY, and Yang ZN. 2007. Intracellular Delivery of Quantum Dots Tagged Antisense Oligodeoxynucleotides by Functionalized Multiwalled Carbon Nanotubes. Nano Letters 7:2976-2980.

3.Cui J, Li P, Li G, Xu F, Zhao C, Li YH, Yang ZN, Wang G, Yu QB, Li YX, and Shi TL. 2007. AtPID: Arabidopsis thaliana protein interactome database—an integrative platform for plant systems biology. Nucleic Acids Research. Advance Access published on October 25, 2007; doi: doi:10.1093/nar/gkm844

4.崔永兰，王鹏程，杨仲南*. 2007. 拟南芥未知功能基因At4g22890编码蛋白的叶绿体定位。云南植物研究. 29(6): 659-664.

5.钟晓丽，张丞，沈英嘉，张永明，杨仲南*。2007. 水稻高效表达启动子的分离。生物工程学报。23（5）：73-77

6.陈辉，李辉，杨仲南。2007.拟南芥雄性不育突变体nps的基因定位.上海师范大学学报 36（1）：44-48

7.王奋飞, 王鹏程, 董瑞斌 , 杨仲南 , 崔永兰 。2007.拟南芥中一个镍离子转运蛋白的亚细胞定位。上海师范大学学报 36（2）：71-76

2006年发表论文：

1. Liu HJ, Zhang ZB, Li H, Gao JF, Yang ZN*. 2006. Fine mapping of an Arabidopsis thaliana male sterile mutant EC2-157. Frontiers of Biology in China 1(3): 270-274.

2.Dong Y, Kamiuten H, Yang ZN, Lin D, Ogawa T, Luo L, Matsuo H. 2006. Mapping of quantitative trait loci for gibberellic acid response at rice (Oryza sativa L.) seedling stage. Plant Science 170: 12-17.

3.俞竹青，朱骏，高菊芳，杨仲南*. 2006.水稻P0491E01基因调控花药发育的功能分析。分子细胞生物学报 39(5): 467-472.

4. 孔萌萌，余庆波，张慧绮，盛春，周根余，杨仲南*. 2006. 控制水稻叶绿体发育基因OsALB23的定位. 植物生理与分子生物学报 32(4): 433-437.

5.王鹏程，王晨，米华玲，周根余，杨仲南*. 2006. 拟南芥中一个未知功能蛋白的叶绿体亚细胞定位研究。植物学通报 23(3):249-254

6.张森，周鹊，陈辉，易君，高菊芳，杨仲南。2006.调控拟南芥花粉发育突变体zy1511的基因定位及特征分析。分子细胞生物学报39（2）：163-168

7.易君,高菊芳,张在宝,江华,周根余,杨仲南,张森 。2006.拟南芥雄性不育突变体ms1502的遗传及定位分析 。云南植物研究 28(3): 283~288

8.江华，杨仲南，高菊芳. 2006. 水稻雄性不育突变体OsMS121的遗传及定位分析。上海师范大学学报（自然科学版）35(6): 71-75

2003—2005年发表论文：

1.Li H, Xu L, Wang H, Yuan Z, Cao XF, Yang ZN, Zhang DB, Xu YQ, and H Huang. 2005. The Putative RNA-dependent RNA Polymerase RDR6 Acts Synergistically with ASYMMETRIC LEAVES1 and 2 to Repress BREVIPEDICELLUS and MicroRNA R165/166 in Arabidopsis Leaf Development. Plant Cell 17(8): 2157-2171

2.Shen YJ, Jiang H, Jin JP, Zhang ZB, Xi B, Wang G, Wang C, Qian L, Li X, Yu QB, Liu HJ, Chen DH, Gao JH, Huang H, Shi TL* & ZN Yang*. 2004. Development of genome-wide DNA polymorphism database for map-based cloning of rice genes. Plant Physiology 135：1198-1205  

3. Yang ZN , XR Ye, J Molina, ML Roose and TE Mirkov. 2003. Sequence analysis of a 282-kb region surrounding the citrus tristeza virus resistance gene ( ctv ) locus in poncirus trifoliata l. Plant Physiology. 131:482-492

4.沈鹤柏，户敏，杨仲南，王晨，朱龙章. 2005. 基于金纳米粒子的聚合酶链反应。科学通报 50(12): 1190-1194

5.刘慧娟，张在宝，高菊芳，杨仲南. 2005. 拟南芥雄性不育突变体EC2-157基因的精细定位。上海师范大学学报（自然科学版） 34（1）：58-63。

6.余庆波，江华，米华玲，周根余，杨仲南。2005。水稻白化突变体alb21生理特性和基因定位。上海师范大学学报（自然科学版） 34（1）：70-75.